「2025應用生技產業年鑑」研究時間範圍為2024年全年，全書架構分為〈產業關鍵議題〉、〈產業總覽〉、〈產業個論〉及〈未來展望〉4大部分，分別解析全球應用生技產業最受注目的關鍵趨勢議題，同時針對應用生技產業各次產業，於全球及臺灣之整體產業環境、政策／法規、產業發展現況等面向分別進行深入研究與剖析，透過綜整國內外應用生技產業重要趨勢變化，歸納產業發展機會與挑戰，進而尋找出我國產業可借鏡的發展因應策略，導引出我國應用生技產業發展建議。
〈產業關鍵議題〉探討與產業發展息息相關的「高齡化之機遇與挑戰」、「應用生技產業推動綠色製造邁向淨零永續」及「AI引領應用生技產業創新」等3關鍵議題。隨著全球邁向超高齡社會的腳步加快，消費者的健康觀念也正在逐步轉變，為延長健康餘命，人們愈加重視長期健康與預防保健，並積極調整生活習慣依據個人需求選擇合適的保健營養品、化妝品或尋求再生醫療解決老化、失能問題，期望為未來的自己打造更健康、樂活的生活方式。面對全球淨零浪潮，應用生技產業亦採取行動導入綠色製造於生產製程中。另一方面，人工智慧（Artificial Intelligence, AI）科技與大數據分析兩者相輔相成，為近來生技醫藥領域之發展焦點，除可協助藥物設計與開發、改善臨床試驗流程外，配合穿戴式裝置的普及，亦使得精準健康得以實現，包括利用基因分析達到疾病預測及預防保健、透過個人化健康監測預警疾病發生等。本年鑑將透過觀察全球應用生技業者面對上述關鍵議題，如何從公司營運、產品生產製造、技術開發等不同面向著手因應，以提供臺灣應用生技產業未來發展思考方向。
〈產業總覽〉內容包含「全球應用生技產業概況」及「臺灣應用生技產業現況」。「全球應用生技產業概況」從全球總體經濟概況導入，一覽全球應用生技產業整體發展趨勢走向。「臺灣應用生技產業現況」則針對2024年我國整體應用生技產業產值、進出口及廠商現況進行分析，以統觀我國應用生技產業的總體發展現況與趨勢脈動。透過〈產業總覽〉藉以了解全球經濟發展與市場趨勢對應用生技產業之潛在影響。
〈產業個論〉部分，針對再生醫療、生技製藥服務業、食品生技、農業生技及生技特化等5個次產業，分別整理分析2024年全球與臺灣的發展概況，包括產業定義與範疇、政策／法規動態、市場概況、主要廠商經營動向、產品／技術／服務等多元面向，藉以觀測比對國內外產業發展現況之差異；並以SWOT分析探討各次產業的機會與挑戰，進而提出我國各次產業未來之發展建議，提供我國產官學研各界參考。
〈未來展望〉洞悉國內應用生技產業的總體發展趨勢與機會，綜觀產業發展現況與走向，提出我國應用生技產業整體發展之對策與展望。