====章節目錄====
1.前言…5
1.1.研究動機與目的…5
1.2.範圍界定…6
1.3.研究方法與架構…9
2.真菌應用…11
2.1.食藥用菌…15
2.2.藥物開發…23
2.3.生物防治…27
2.4.特用化學品…31
3.真菌基因體簡介…40
3.1.真菌基因體發展歷程…41
3.2.相關研究機構.…58
3.2.1.美國…58
3.2.2.歐洲…85
3.2.3.亞洲…93
3.3.真菌基因體的應用…100
3.3.1.疫病檢測與品種鑑定…101
3.3.2.真菌工廠…106
3.3.3.生物晶片…116
4.真菌基因體技術發展…122
4.1.真菌基因體關鍵技術…122
4.2.基因體技術對抗感染症藥物開發的影響…141
4.3.開發抗感染先導藥物關鍵成功因素分析…144
4.4.開發先導藥物技術路徑圖…150
5.結論與建議…160
5.1.真菌基因體進展與應用…160
5.2.真菌基因體在開發先導藥物的角色…166
5.3.未來發展機會…166
====表目錄====
表1-1 真菌界分類…8
表1-2 食品所真菌基因體開發抗感染症(抗病毒為例)先導藥物討論會...9
表2-1 微生物種類數目…11
表2-2 真菌的應用與害處…12
表2-3 全球真菌應用市場…13
表2-4 真菌次級代謝路徑及其產物…13
表2-5 真菌次級代謝物例舉…14
表2-6 真菌次級代謝物開發新藥的優勢…15
表2-7 藥用真菌與主要用途…16
表2-8 藥用真菌功能列舉…16
表2-9 靈芝的生物活性及有效成分…17
表2-10 蟲草新資源的應用…18
表2-11 利用微生物發酵生產紫杉醇的優點…25
表2-12 輔酵素Q10生產方法…25
表2-13 商業上常用管理蔬果榖物疾病生物防治的真菌與酵母…29
表2-14 真菌多糖的生理活性…32
表2-15 臨床試驗的食藥用菌多糖…33
表2-16 月見草萃取與真菌發酵生產-次亞麻油酸比較…34
表2-17 次亞麻油酸生產真菌…35
表3-1 生物醫學研究的轉變…40
表3-2 已完成與進行中基因體定序…42
表3-3 已完成真菌基因體定序…45
表3-3 已完成真菌基因體定序(續)…46
表3-4 酵母(S. cerevisiae )S288C基因體定序…47
表3-5 進行中真菌基因體定序…48
表3-5 進行中真菌基因體定序(續)…49
表3-6 擔子菌(basidiomycetes)基因體計畫…58
表3-7 TIGR微生物基因體定序策略例舉…59
表3-8 TIGR微生物基因體計劃(已完成)…60
表3-9 TIGR微生物基因體計劃(進行中)…61
表3-10 真菌基因體先導優先定序真菌(第一版白皮書)…65
表3-11 真菌基因體先導計劃進行中菌株…66
表3-12 真菌基因體先導優先定序真菌(第二版白皮書)…67
表3-13 真菌基因體先導的目標(第三次白皮書)…70
表3-14 聖路易華盛頓大學細菌基因體研究計劃…83
表3-15 奧克拉荷馬大學基因體研究…84
表3-16 英國桑格中心微生物(細菌)基因體研究…86
表3-17 英國桑格中心真菌基因體研究…88
表3-18 法國巴斯特研究所基因體計劃…89
表3-19 法國國家定序中心Genoscope基因體計劃…90
表3-20 荷蘭DMS參與的基因體研究…92
表3-21 DMS微生物相關產品例舉…92
表3-22 日本財團法人製品評價技術基盤機構微生物基因體解析…95
表3-23 日本北里大學基因體研究優先順序…97
表3-24 國內學研單位技術發展近況…99
表3-25 物病理學利用PCR相關技術…105
表3-26 具發展潛力的子囊菌門(Ascomycota)真菌宿主系統…109
表3-27 具發展潛力的真菌宿主系統…110
表3-28 美國重組藥物平均價格…111
表3-29 大腸桿菌/CHO生產TPA成本比較…112
表3-30 各種重組蛋白質藥物的生產成本…112
表3-31 開發中基因改良作物生產產品…112
表3-32 利用酵母菌與真菌宿主生產IL-6…114
表3-33 真菌宿主生產Phanerochaete chrysosporium的錳過氧化酵素…115
表3-34 全球微陣列(Microarry)市場預估…116
表4-1 選殖載體…124
表4-2 RNA干擾的應用…130
表4-3 基因功能技術突破問題…131
表4-4 啟動子選殖法…139
表4-5 標靶選擇的基因技術…144
表4-6 「食品所利用真菌基因體開發抗感染症先導藥物」技術發展的關鍵成功因素…148
表4-6 「食品所利用真菌基因體開發抗感染症先導藥物」技術發展的關鍵成功因素(續)…149
表4-7 2000年全球抗感染用藥…150
表4-8 抗病毒藥物市場佔有率…150
表4-9 抗HIV病毒藥物市場佔有率…151
表4-10 利用真菌基因體技術開發抗病毒先導藥物Roadmap…152
表4-10 利用真菌基因體技術開發抗病毒先導藥物Roadmap(續)…154
表4-10 利用真菌基因體技術開發抗病毒先導藥物Roadmap(續2)…159
表4-11 可用於組合合成的生物催化反應…157
表5-1 國內真菌類「健康食品」許可項目…162
表5-2 真菌基因體對真菌的影響…165
====圖目錄====
圖1-1 真菌的分類…7
圖1-2 研究架構…10
圖3-1 已開發/進行中真菌基因體分類…57
圖3-2 微生物基因體解析流程…94
圖3-3 麴菌(Aspergillus oryzae)基因體解析與應用…96
圖4-1 基因體工業可能的經濟效益…122
圖4-2 目前蛋白質體相關技術…134
圖4-3 蛋白質體技術演進過程…134
圖4-4 Quantitative proteomics and informatics…135
圖4-5 真菌基因體關鍵技術關聯圖…140
圖4-6 基因體在藥物開發與發展的影響…141
圖4-7 組合生物合成新的生物分子途徑…157